زمینه و هدف: انجمنهای علمی نیازمند ارزیابی عملکرد متناسب با اهداف سازمانی خود بوده و ارزیابی عملکرد نیازمند تدوین شاخص های کارکردی و مناسب است . از این رو این مطالعه با هدف تعیین شاخصهای ارزیابی عملکرد انجمنهای علمی پزشکی و اجرای آزمایشی (پایلوت) شاخصها انجام شده است تا راهنمای مناسبی برای ارزیابی انجمنهای علمی پزشکی باشد. روش بررسی: این مطالعه یک پژوهش توصیفی - کاربردی است. جامعه پژوهش انجمن های علمی پزشکی کشور است. جهت طراحی شاخصها شش گام بررسی متون و مطالعات کتابخانهای، استخراج وظایف انجمنهای علمی پزشکی، شناسایی، استخراج و طبقهبندی شاخصهای ارزیابی انجمنهای علمی پزشکی، اعتبارسنجی و نهاییسازی شاخصها، تعیین ملاک نمره دهی به شاخصها، وزندهی به شاخصها و اجرای آزمایشی شاخصها (طرح پایلوت) در بین گروه های 4 گانه انجمن های بالینی، انجمن های علوم پایه پزشکی و بهداشت، انجمن های داروسازی و انجمن های دندانپزشکی بینرشتهای انجام شده است. یافتهها: برای ارزیابی عملکرد انجمنهای علمی کشور 7 حوزه (نیروی انسانی و اسکان دفتر انجمن، انتشارات، فناوری، آموزش و پژوهش، ارتباطات بینالمللی، برنامهریزی و تشکیلات و توانمندی انجمن) و 26 شاخص شناسایی شد. بحث و نتیجهگیری: ارزیابی عملکرد موجب هوشمندی سیستم و برانگیختن افراد بهمنظور رفتار مطلوب میشود و انـدازهگیـری عملکـرد و بهکارگیری الگوی مناسب با وضعیت موجود سازمان، امری لازم و ضروری میباشـد. واژگان کلیدی: شاخص، ارزیابی عملکرد، انجمنهای علمی پزشکی